Конец 80-х – начало 90-х годов – время социальных и политических катаклизмов, что, в свою очередь, сильно повлияло на психику рядового обывателя. Как никогда остро в обществе ощутилась нехватка профессиональных психотерапевтов, психиатров с медицинским образованием.

Первым за решение проблемы подготовки специалистов в области психического здоровья в Беларуси взялся Владимир Семёнович Васильев, занимавший в то время должность первого проректора Гродненского государственного медицинского института. Человек передовых взглядов, он отлично понимал всю перспективность организации факультета с психологическим уклоном. Тем более, что определённые наработки в этом деле уже были. Плодотворно работала в институте кафедра психиатрии, которую возглавлял Обухов Геннадий Алексеевич. Именно при этой кафедре был организован курс общей психологии, где начинали работать первые преподаватели и обучаться первые студенты медико-психологического факультета.

Когда Владимир Семёнович обратился в Министерство здравоохраненения с обоснованными предложениями об открытии медико-психологического факультета, он сразу же нашёл понимание среди руководства министерством. Большую роль в положительном решении вопроса сыграла, безусловно, Чернобыльская трагедия. Белорусы остро почувствовали её последствия, связанные с психосоматическими заболеваниями, многочисленными стрессами. Поэтому общественность ощущала большую необходимость в медицинских психологах, психотерапевтах, наркологах. 

В апреле 1993 года было принято решение об организации медико-психологического факультета. В этом же году был осуществлен первый набор студентов. Михаил Михайлович Петкевич одновременно возгавлял педиатрический, медико-психологический факультеты и отделение медицинских сестер с высшим образованием. С октября 1997 г. эту должность занимал Геннадий Григорьевич Мармыш, а с мая 1998 г. Константин Устинович Вильчук.

С 1 сентября 1998 года приказом ректора института организован  самостоятельный медико-психологический факультет, первым деканом которого стала Шамова Татьяна Михайловна.

С 2006 года по 2010 год медико-психологический факультет возглавляла Карпюк Валентина Алексеевна. С 2010 года по сегодняшний день на должности декана работает профессор Шамова Татьяна Михайловна.

За время существования факультета создана нормативно-правовая и учебно-методическая база специальности “медико-психологическое дело”. За 25 лет на факультете потовлено 1029 врачей, 82 выпускника получили диплом с отличием. Около 25% выпускников факультета являются руководителями структурных подразделении психиатрических и наркологических учереждений здравоохранения

Медико-психологический факультет сегодня объединяет семь кафедр: психологии и педагогики, медицинской психологии и психотерапии, психиатриии и наркологии, неврологии и нейрохирургии, медицинской реабилитации, 2-ю кафедру внутренних болезней, 2-ю кафедру хирургических болезней. На кафедрах факультета работает 74 преподавателя. Их них: докторов наук – 10 (в том числе профессоров – 8); кандидатов наук – 33 (в том числе доцентов – 19).

Факультет осуществляет подготовку по специальности 1- 79 01 05 Медико-психологическое дело. Выпускникам присваивается квалификация «врач», после интернатуры: врач-психиатр-нарколог, врач-психотерапевт, врач-невролог.