На кафедре функционирует музей, который, согласно изучаемым предметам, имеет соответствующие тематические разделы: нормальная и патологическая анатомия, топографическая анатомия, оперативная хирургия, врожденная патология.

Музейная экспозиция насчитывает более 150 различных препаратов: влажных, коррозионных, костных и т.п.

Помимо этого, в музее имеется более 25 муляжей, манекенов и топографо-анатомических моделей, а также стенды с хирургическим инструментарием.

Музей имеет специфическую направленность для различных факультетов университета. Так, для педиатрического факультета оформлена экспозиция по анатомическому строению и топографии, а также врожденной патологии, органов грудной и брюшной полости новорожденных детей в виде муляжей и влажных препаратов. Врожденная патология представлена аномалиями и пороками опорно-двигательного аппарата, лица, ЦНС, внутренних органов, близнецовыми уродствами и др. Для медико-диагностического факультета – муляжи и влажные препараты в виде «пироговских» срезов, имеющих ценность при изучении интерпретации КТ- и МРТ- изображений.

Помещение для музея сочетает в себе функцию конференц-зала, где читаются лекции для малых факультетов, проводятся практические и факультативные занятия, заседания СНК и студенческие научные конференции, а также осуществляется просмотр учебных видеофильмов по топографической анатомии и различным оперативным вмешательствам.